根据相关法律规定，农民工工资保证金确实可以使用金融机构出具的保函来替代。《保障农民工工资支付条例》第三十二条明确指出，“工资保证金可以用金融机构保函替代”，这意味着除了传统的现金缴存方式外，还可以通过保函的方式来满足这一制度的要求。
保函的有效期通常从开立之日起到工程合同预计竣工日期延长3个月为止。如果工程未按时完工，申请人在保函到期前需要办理延期手续。当工程项目出现拖欠农民工工资的情况时，由人社部门和行业主管部门共同出具书面通知，启动保函赔付程序。金融机构需要在收到通知后的3个工作日内划拨资金至指定的账户，用于支付拖欠的工资。
租赁保函是保证人应承租人的要求，向出租人开立的保证，承租人按照合同的规定支付租金，否则将由保证人进行赔付的书面保证文件。租赁保函的金额应与租金及相应的利息相等，一般自承租人收到租赁设备并验收合格后生效，至承担人支付完全部的租金或双方的时期失效。
租赁保函作用
1、对出租方
·便利了租赁合约的执行；
·获得了及时收回租金的保障。
2、对承租方
·有利于承租方取得设备使用权；
·获得资金融通、促进资金周转。